Nằm trong khu vực xứ Kẻ Mèn, Minh Nghĩa đón nhân Tin Mừng khá sớm, khoảng thế kỷ XVII.
Năm 1929, giáo họ Minh Nghĩa được thành lập, thuộc xứ Đông Thành, nhận Thánh Giuse làm quan thầy (lúc này chưa có nhà thờ).
Năm 1930, Minh Nghĩa được cắt về giáo xứ Thanh Minh khi giáo xứ này được thành lập .
Năm 1932, giáo họ khởi công xây dựng Thánh đường, và được hoàn thành năm 1936. Năm 1950, người Pháp đổ bộ vào Nô Cốt (bến Bồng He ngày nay), bắn cháy Nhà thờ, sau đó giáo họ sửa sang lại. Trải qua năm tháng, ngôi Thánh đường xuống cấp được giáo họ đại tu và xây dựng khuôn viên khang trang vào năm 1989.
Số giáo dân ngày càng gia tăng, ngôi Thánh đường cũ không đáp ứng được nhu cầu sinh hoạt tôn giáo của bà con giáo dân, năm 2004, giáo họ xây dựng ngôi Nhà thờ mới với chiều dài 30m, rộng 13m, cao 12m.
Năm 2009, giáo xứ lại hoàn thành thêm ngôi nhà giáo lí.
Ngày 14 tháng 12 năm 2009, Đức cha Phanxicô Xaviê Nguyễn Văn Sang đã ban Sắc nâng Giáo họ Minh Nghĩa lên hàng giáo xứ.